Ustroj mobilne aplikacije za pošiljanje sporočil (in v prihodnosti tudi glasovne storitve) dopušča resno varnostno pomanjkljivost, ki napadalcu omogoča globlji poseg v zasebnost uporabnika, kot bi slednji želel. Čeprav je WhatsApp napovedal šifriranje pogovorov, imajo po drugi strani v samem dizajnu luknjo, ki sicer ne omogoča prisluškovanja komunikaciji, omogoča pa pridobivati podatke o aktivnosti uporabnika.

Aplikacija Whisper, ki naj bi uporabnikom omogočala anonimno razkrivanje skrivnosti na internetu, ni tako anonimna, kot se je zdelo. The Guardian je razkril, kako se podatki o uporabnikovi lokaciji zbirajo, četudi tega ne želi, da Whisper sodeluje z ameriškim obrambnim ministrstvom in da se vse objavljeno shranjujejo za nedoločen čas.